多囊性肾病的病因主要是先天性发育不良和遗传基因缺失。诱发因素主要有毒素和感染，都容易诱发病情加重。

一、先天因素

1、先天性发育不良：对于多囊性肾病，主要可引起髓质海绵肾和发育不全的多囊肾病。

2、遗传因素：对于多囊性肾病来说，大部分是由父母基因遗传，分为常染色体显性遗传和常染色体隐性遗传。但有些多囊肾患者既不是父母遗传，也不属于先天性发育不良型多囊肾，而是胚胎形成过程中的基因突变所导致。

二、诱发因素

1、毒素：毒素作用于人体，可能对各种细胞、组织、器官造成损害，导致疾病，甚至危及生命。有些药物还具有肾毒性，如卡那霉素、庆大霉素、磺胺类、利福平、吲哚美辛等西药，以及蜈蚣、马钱子、关木通、马兜铃等中药。如果这些药物使用不当，很容易造成肾脏损害。

2、各种感染：常见感染包括上呼吸道感染、尿路感染、胃肠道感染、皮肤感染、外伤感染、器械感染等，这些细菌感染或病毒感染对囊肿的影响很大。感染可引起机体内环境的异常变化，身体任何部位的任何感染都会通过血液进入肾脏，从而影响囊肿。如果囊肿被感染，不仅会加重临床症状，还会加速囊肿的生长，加重肾功能损害。